Гибоидизационный анализ ДНК на основе комплексов флуоресцентных олигонуклеотидных зондов с углеродными нанотрубками

Abstract

Однонуклеотидные замены (ОНП – однонуклеотидный полиморфизм, SNP – Singl Nucleotide Polymorphism) являются наиболее часто встречающимися генетическими вариациями генома. Огромное количество SNP в геноме человека, а также низкий уровень мутаций на поколение определяют перспективность их использования в качестве генетических маркеров. Значительная часть методов детекции SNP основана на использовании гибридизационных флуоресцентных зондов (олигонуклеотидов с ковалентно связанными репортёрными группами: флуоресцентной и тушащей), образующих специфический комплекс с ДНК-мишенями. Эффективными гибридизационными зондами являются «молекулярные маяки» (англ, moleculer beacons) – олигонуклеотиды, образующие шпилечную структуру и несущие по разным концам молекулы флуорофор и тушитель флуоресценции. Использование «молекулярных маяков» для визуализации SNP основывается на их способности менять интенсивность флуоресценции в зависимости от присутствия или отсутствия целевой мишени для гибридизации.